나이트록스용 스쿠바 실린더의 사용은 현지의 법률과 제조사의 사양에 따라 운영되며 이런 운영 규칙에는 주기적인 수압 검사와 시각검사 등이 포함된다. 뿐만 아니라 나이트록스용 스쿠바 실린더와 연관되어 업계에서 통용되는 규칙이 추가된다.
업계에서 통용되는 규칙 중의 하나는 나이트록스용 실린더에는 넓은 초록색과 노랑색 띠에 나이트록스(Nitrox) 또는 EAN(Enriched Air Nitrox)이라고 선명하게 인쇄된 스티커를 부착하는 것이다. 이렇게 함으로써 다이버는 실린더에 공기와는 다른 호흡기체가 들어있다는 것을 알 수 있다.
이론적으로 나이트록스 스토리지 뱅크에서 또는 연속흐름 방식으로 이미 혼합된 나이트록스를 실린더에 충전할 경우에는 40% 규칙을 따르고 특별한 조치를 할 필요가 없다고 말하기도 한다. 그러나 가장 널리 사용되는 부분압 방식에서는 실린더와 밸브가 100% 산소에 노출되기 때문에 산소 서비스를 받아야 한다. 산소 서비스란 주로 탱크와 밸브 내부에 화재나 폭발을 일으킬 수 있는 오링이나 윤활유 같은 물질을 교환하거나 제거하는 산소청소를 말한다. 산소 서비를 정확하게 실시하기 위해서는 TDI 산소 장비 서비스 테크니션 교육이 필요하다. 산소 서비스를 실시한 기술자는 실린더에 산소 청소가 되었음을 증명하는 스티커를 부착한다.
또한 실린더 내부에 충전된 나이트록스의 성분은 실린더에 부착된 성분기록 스티커(contents label)에 기록한다. 성분기록 스티커에는 최소한 산소의 성분과 최대허용수심(MOD) 및 허용 산소부분압, 충전 리조트나 다이브센터, 분석자의 이름 약자, 분석한 날짜 등을 기록해야 한다.
헬륨과 관련된 사항은 TDI 트라이믹스 다이버가 사용하는 항목이다.
실린더가 준비된 이후에 산소 청결상태를 유지하는 것은 사용자의 책임이다. 물론 실린더에 공기를 충전할 수도 있지만 산소호환성 공기를 충전해야 한다. 만약 실린더에 일반 공기를 충전하였다면 다음 나이트록스를 사용하기 전에 반드시 산소 청소를 실시해야 한다.